Protein–RNA interactions for Protein: P40202

CCS1, Superoxide dismutase 1 copper chaperone, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CCS1P40202 RTT102YGR275W 474 nt0.8□□□□□ -2.28
CCS1P40202 LIN1YHR156C 1023 nt0.8□□□□□ -2.28
CCS1P40202 EMC5YIL027C 426 nt0.8□□□□□ -2.28
CCS1P40202 ABM1YJR108W 372 nt0.8□□□□□ -2.28
CCS1P40202 YLR217WYLR217W 324 nt0.8□□□□□ -2.28
CCS1P40202 BRX1YOL077C 876 nt0.8□□□□□ -2.28
CCS1P40202 YOL106WYOL106W 354 nt0.8□□□□□ -2.28
CCS1P40202 YPL080CYPL080C 327 nt0.8□□□□□ -2.28
CCS1P40202 YPR172WYPR172W 603 nt0.8□□□□□ -2.28
CCS1P40202 RAD50YNL250W 3939 nt0.8□□□□□ -2.28
CCS1P40202 MAK10YEL053C 2202 nt0.79□□□□□ -2.28
CCS1P40202 YER138W-AYER138W-A 105 nt0.79□□□□□ -2.28
CCS1P40202 CRG1YHR209W 876 nt0.79□□□□□ -2.28
CCS1P40202 SMD3YLR147C 306 nt0.79□□□□□ -2.28
CCS1P40202 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt0.79□□□□□ -2.28
CCS1P40202 YOR364WYOR364W 369 nt0.79□□□□□ -2.28
CCS1P40202 SMC1YFL008W 3678 nt0.79□□□□□ -2.28
CCS1P40202 REF2YDR195W 1602 nt0.78□□□□□ -2.28
CCS1P40202 YFR057WYFR057W 456 nt0.78□□□□□ -2.28
CCS1P40202 YGL217CYGL217C 342 nt0.78□□□□□ -2.28
CCS1P40202 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt0.78□□□□□ -2.28
CCS1P40202 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt0.78□□□□□ -2.28
CCS1P40202 RPL40BYKR094C 387 nt0.78□□□□□ -2.28
CCS1P40202 YLL020CYLL020C 306 nt0.78□□□□□ -2.28
CCS1P40202 TIM18YOR297C 579 nt0.78□□□□□ -2.28
CCS1P40202 FMP23YBR047W 528 nt0.78□□□□□ -2.28
CCS1P40202 DOP1YDR141C 5097 nt0.78□□□□□ -2.28
CCS1P40202 UBP3YER151C 2739 nt0.78□□□□□ -2.29
CCS1P40202 CDC39YCR093W 6327 nt0.78□□□□□ -2.29
CCS1P40202 RRI2YOL117W 1938 nt0.77□□□□□ -2.29
CCS1P40202 RCN1YKL159C 636 nt0.77□□□□□ -2.29
CCS1P40202 RPL37AYLR185W 267 nt0.77□□□□□ -2.29
CCS1P40202 RPS18BYML026C 441 nt0.77□□□□□ -2.29
CCS1P40202 YNL150WYNL150W 408 nt0.77□□□□□ -2.29
CCS1P40202 YNL235CYNL235C 432 nt0.77□□□□□ -2.29
CCS1P40202 YCL046WYCL046W 324 nt0.77□□□□□ -2.29
CCS1P40202 MUK1YPL070W 1839 nt0.77□□□□□ -2.29
CCS1P40202 SLX4YLR135W 2247 nt0.76□□□□□ -2.29
CCS1P40202 MDM32YOR147W 1869 nt0.76□□□□□ -2.29
CCS1P40202 SWT1YOR166C 1377 nt0.76□□□□□ -2.29
CCS1P40202 KAR1YNL188W 1302 nt0.76□□□□□ -2.29
CCS1P40202 SPC1YJR010C-A 285 nt0.76□□□□□ -2.29
CCS1P40202 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt0.76□□□□□ -2.29
CCS1P40202 PAU24YBR301W 363 nt0.76□□□□□ -2.29
CCS1P40202 YBR184WYBR184W 1572 nt0.75□□□□□ -2.29
CCS1P40202 SPR3YGR059W 1539 nt0.75□□□□□ -2.29
CCS1P40202 IES5YER092W 378 nt0.75□□□□□ -2.29
CCS1P40202 PRE4YFR050C 801 nt0.75□□□□□ -2.29
CCS1P40202 RPL42BYHR141C 321 nt0.75□□□□□ -2.29
CCS1P40202 CMS1YLR003C 876 nt0.75□□□□□ -2.29
CCS1P40202 SPC2YML055W 537 nt0.75□□□□□ -2.29
CCS1P40202 RPL42AYNL162W 321 nt0.75□□□□□ -2.29
CCS1P40202 ATP20YPR020W 348 nt0.75□□□□□ -2.29
CCS1P40202 SEF1YBL066C 3447 nt0.75□□□□□ -2.29
CCS1P40202 BUD3YCL014W 4911 nt0.75□□□□□ -2.29
CCS1P40202 SEC3YER008C 4011 nt0.74□□□□□ -2.29
CCS1P40202 ZRG17YNR039C 1818 nt0.74□□□□□ -2.29
CCS1P40202 MRPL32YCR003W 552 nt0.74□□□□□ -2.29
CCS1P40202 RSM27YGR215W 333 nt0.74□□□□□ -2.29
CCS1P40202 YGR265WYGR265W 411 nt0.74□□□□□ -2.29
CCS1P40202 DDR48YMR173W 1293 nt0.74□□□□□ -2.29
CCS1P40202 YLL054CYLL054C 2532 nt0.74□□□□□ -2.29
CCS1P40202 IFH1YLR223C 3258 nt0.73□□□□□ -2.29
CCS1P40202 CHZ1YER030W 462 nt0.73□□□□□ -2.29
CCS1P40202 snR14snR14 160 nt0.73□□□□□ -2.29
CCS1P40202 VPS54YDR027C 2670 nt0.72□□□□□ -2.29
CCS1P40202 SNO3YFL060C 669 nt0.72□□□□□ -2.29
CCS1P40202 MRPS8YMR158W 468 nt0.72□□□□□ -2.29
CCS1P40202 YBL073WYBL073W 312 nt0.72□□□□□ -2.29
CCS1P40202 SNO2YNL334C 669 nt0.72□□□□□ -2.29
CCS1P40202 YPR170CYPR170C 336 nt0.72□□□□□ -2.29
CCS1P40202 SGO1YOR073W 1773 nt0.72□□□□□ -2.29
CCS1P40202 NUP120YKL057C 3114 nt0.72□□□□□ -2.29
CCS1P40202 VPS52YDR484W 1926 nt0.72□□□□□ -2.29
CCS1P40202 EAF1YDR359C 2949 nt0.71□□□□□ -2.29
CCS1P40202 PAU2YEL049W 363 nt0.71□□□□□ -2.3
CCS1P40202 PAU18YLL064C 363 nt0.71□□□□□ -2.3
CCS1P40202 YLR366WYLR366W 306 nt0.71□□□□□ -2.3
CCS1P40202 COX7YMR256C 183 nt0.71□□□□□ -2.3
CCS1P40202 PAU6YNR076W 363 nt0.71□□□□□ -2.3
CCS1P40202 ERP4YOR016C 624 nt0.71□□□□□ -2.3
CCS1P40202 SHE9YDR393W 1371 nt0.7□□□□□ -2.3
CCS1P40202 snR79snR79 84 nt0.7□□□□□ -2.3
CCS1P40202 RTR1YER139C 681 nt0.7□□□□□ -2.3
CCS1P40202 RPL9BYNL067W 576 nt0.7□□□□□ -2.3
CCS1P40202 GDS1YOR355W 1569 nt0.7□□□□□ -2.3
CCS1P40202 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt0.69□□□□□ -2.3
CCS1P40202 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt0.69□□□□□ -2.3
CCS1P40202 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt0.69□□□□□ -2.3
CCS1P40202 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt0.69□□□□□ -2.3
CCS1P40202 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt0.69□□□□□ -2.3
CCS1P40202 YCL020WYCL020W 1317 nt0.69□□□□□ -2.3
CCS1P40202 MPC1YGL080W 393 nt0.69□□□□□ -2.3
CCS1P40202 YGR115CYGR115C 780 nt0.69□□□□□ -2.3
CCS1P40202 YIR020CYIR020C 303 nt0.69□□□□□ -2.3
CCS1P40202 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt0.69□□□□□ -2.3
CCS1P40202 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt0.69□□□□□ -2.3
CCS1P40202 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt0.69□□□□□ -2.3
CCS1P40202 snR5snR5 204 nt0.68□□□□□ -2.3
CCS1P40202 YGL230CYGL230C 444 nt0.68□□□□□ -2.3
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