Protein–RNA interactions for Protein: P38798

NMD2, Nonsense-mediated mRNA decay protein 2, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD2P38798 TRL1YJL087C 2484 nt2.78□□□□□ -1.96
NMD2P38798 IRA2YOL081W 9240 nt2.78□□□□□ -1.96
NMD2P38798 YER137W-AYER137W-A 306 nt2.78□□□□□ -1.96
NMD2P38798 RPL9BYNL067W 576 nt2.78□□□□□ -1.96
NMD2P38798 TOF1YNL273W 3717 nt2.78□□□□□ -1.96
NMD2P38798 RTT107YHR154W 3213 nt2.78□□□□□ -1.96
NMD2P38798 RBK1YCR036W 1002 nt2.77□□□□□ -1.97
NMD2P38798 YDL011CYDL011C 324 nt2.77□□□□□ -1.97
NMD2P38798 YDL152WYDL152W 366 nt2.77□□□□□ -1.97
NMD2P38798 VPS8YAL002W 3825 nt2.77□□□□□ -1.97
NMD2P38798 HSK3YKL138C-A 210 nt2.77□□□□□ -1.97
NMD2P38798 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.77□□□□□ -1.97
NMD2P38798 DIS3YOL021C 3006 nt2.77□□□□□ -1.97
NMD2P38798 CSF1YLR087C 8877 nt2.76□□□□□ -1.97
NMD2P38798 SNF5YBR289W 2718 nt2.76□□□□□ -1.97
NMD2P38798 YBR184WYBR184W 1572 nt2.76□□□□□ -1.97
NMD2P38798 VMA9YCL005W-A 222 nt2.76□□□□□ -1.97
NMD2P38798 APL5YPL195W 2799 nt2.75□□□□□ -1.97
NMD2P38798 GRR1YJR090C 3456 nt2.75□□□□□ -1.97
NMD2P38798 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt2.75□□□□□ -1.97
NMD2P38798 PGA1YNL158W 597 nt2.75□□□□□ -1.97
NMD2P38798 YBL108WYBL108W 306 nt2.75□□□□□ -1.97
NMD2P38798 RUD3YOR216C 1455 nt2.75□□□□□ -1.97
NMD2P38798 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.74□□□□□ -1.97
NMD2P38798 YLR053CYLR053C 327 nt2.74□□□□□ -1.97
NMD2P38798 YBL083CYBL083C 426 nt2.74□□□□□ -1.97
NMD2P38798 IST2YBR086C 2841 nt2.74□□□□□ -1.97
NMD2P38798 PAN3YKL025C 2040 nt2.74□□□□□ -1.97
NMD2P38798 VPS13YLL040C 9435 nt2.74□□□□□ -1.97
NMD2P38798 SEF1YBL066C 3447 nt2.74□□□□□ -1.97
NMD2P38798 RTT101YJL047C 2529 nt2.73□□□□□ -1.97
NMD2P38798 WIP1YDR374W-A 270 nt2.73□□□□□ -1.97
NMD2P38798 TOF2YKR010C 2316 nt2.73□□□□□ -1.97
NMD2P38798 CDC60YPL160W 3273 nt2.73□□□□□ -1.97
NMD2P38798 SEC16YPL085W 6588 nt2.72□□□□□ -1.97
NMD2P38798 SLM1YIL105C 2061 nt2.72□□□□□ -1.97
NMD2P38798 ZRG8YER033C 3231 nt2.72□□□□□ -1.97
NMD2P38798 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt2.72□□□□□ -1.97
NMD2P38798 YDL062WYDL062W 426 nt2.71□□□□□ -1.98
NMD2P38798 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt2.71□□□□□ -1.98
NMD2P38798 TFC3YAL001C 3483 nt2.7□□□□□ -1.98
NMD2P38798 YGR035CYGR035C 351 nt2.7□□□□□ -1.98
NMD2P38798 PEX4YGR133W 552 nt2.7□□□□□ -1.98
NMD2P38798 TIM13YGR181W 318 nt2.7□□□□□ -1.98
NMD2P38798 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.7□□□□□ -1.98
NMD2P38798 YOL098CYOL098C 3114 nt2.7□□□□□ -1.98
NMD2P38798 YDR341CYDR341C 1824 nt2.7□□□□□ -1.98
NMD2P38798 DNF1YER166W 4716 nt2.69□□□□□ -1.98
NMD2P38798 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.69□□□□□ -1.98
NMD2P38798 SIR4YDR227W 4077 nt2.69□□□□□ -1.98
NMD2P38798 YCR043CYCR043C 384 nt2.68□□□□□ -1.98
NMD2P38798 YAP6YDR259C 1152 nt2.68□□□□□ -1.98
NMD2P38798 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt2.68□□□□□ -1.98
NMD2P38798 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.68□□□□□ -1.98
NMD2P38798 TMA10YLR327C 261 nt2.68□□□□□ -1.98
NMD2P38798 PCF11YDR228C 1881 nt2.68□□□□□ -1.98
NMD2P38798 SAP190YKR028W 3102 nt2.68□□□□□ -1.98
NMD2P38798 IRR1YIL026C 3453 nt2.67□□□□□ -1.98
NMD2P38798 AIM9YER080W 1884 nt2.67□□□□□ -1.98
NMD2P38798 YJR003CYJR003C 1560 nt2.67□□□□□ -1.98
NMD2P38798 VTC1YER072W 390 nt2.67□□□□□ -1.98
NMD2P38798 RPA34YJL148W 702 nt2.67□□□□□ -1.98
NMD2P38798 RPS27AYKL156W 249 nt2.67□□□□□ -1.98
NMD2P38798 YPR197CYPR197C 564 nt2.67□□□□□ -1.98
NMD2P38798 SYH1YPL105C 2550 nt2.67□□□□□ -1.98
NMD2P38798 RPL37BYDR500C 267 nt2.66□□□□□ -1.98
NMD2P38798 RPS24AYER074W 408 nt2.66□□□□□ -1.98
NMD2P38798 RPL26AYLR344W 384 nt2.66□□□□□ -1.98
NMD2P38798 YML003WYML003W 873 nt2.66□□□□□ -1.98
NMD2P38798 ISF1YMR081C 1017 nt2.66□□□□□ -1.98
NMD2P38798 CYB5YNL111C 363 nt2.66□□□□□ -1.98
NMD2P38798 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.65□□□□□ -1.99
NMD2P38798 DAD4YDR320C-A 219 nt2.65□□□□□ -1.99
NMD2P38798 BRP1YGL007W 378 nt2.65□□□□□ -1.99
NMD2P38798 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt2.65□□□□□ -1.99
NMD2P38798 RPL32YBL092W 393 nt2.65□□□□□ -1.99
NMD2P38798 BNI1YNL271C 5862 nt2.65□□□□□ -1.99
NMD2P38798 RPH1YER169W 2391 nt2.65□□□□□ -1.99
NMD2P38798 NAM7YMR080C 2916 nt2.64□□□□□ -1.99
NMD2P38798 RPL27BYDR471W 411 nt2.64□□□□□ -1.99
NMD2P38798 GCN4YEL009C 846 nt2.64□□□□□ -1.99
NMD2P38798 UBP1YDL122W 2430 nt2.64□□□□□ -1.99
NMD2P38798 ALK2YBL009W 2031 nt2.64□□□□□ -1.99
NMD2P38798 INO80YGL150C 4470 nt2.64□□□□□ -1.99
NMD2P38798 STH1YIL126W 4080 nt2.63□□□□□ -1.99
NMD2P38798 MCD1YDL003W 1701 nt2.63□□□□□ -1.99
NMD2P38798 RTR1YER139C 681 nt2.63□□□□□ -1.99
NMD2P38798 RPL42BYHR141C 321 nt2.63□□□□□ -1.99
NMD2P38798 YKL083WYKL083W 615 nt2.63□□□□□ -1.99
NMD2P38798 RPL42AYNL162W 321 nt2.63□□□□□ -1.99
NMD2P38798 YPL229WYPL229W 621 nt2.63□□□□□ -1.99
NMD2P38798 PLC1YPL268W 2610 nt2.63□□□□□ -1.99
NMD2P38798 SAP185YJL098W 3177 nt2.62□□□□□ -1.99
NMD2P38798 YJR098CYJR098C 1971 nt2.62□□□□□ -1.99
NMD2P38798 PET309YLR067C 2898 nt2.62□□□□□ -1.99
NMD2P38798 YDR008CYDR008C 351 nt2.62□□□□□ -1.99
NMD2P38798 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt2.62□□□□□ -1.99
NMD2P38798 PHS1YJL097W 654 nt2.62□□□□□ -1.99
NMD2P38798 YNL058CYNL058C 951 nt2.62□□□□□ -1.99
NMD2P38798 UTP22YGR090W 3714 nt2.62□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 85.4 ms