Protein–RNA interactions for Protein: P38398

BRCA1, Breast cancer type 1 susceptibility protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA1P38398 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRCA1P38398 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRCA1P38398 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRCA1P38398 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRCA1P38398 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRCA1P38398 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRCA1P38398 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRCA1P38398 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRCA1P38398 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRCA1P38398 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRCA1P38398 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRCA1P38398 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BRCA1P38398 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BRCA1P38398 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRCA1P38398 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRCA1P38398 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRCA1P38398 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRCA1P38398 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRCA1P38398 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BRCA1P38398 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BRCA1P38398 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BRCA1P38398 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BRCA1P38398 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRCA1P38398 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRCA1P38398 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRCA1P38398 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRCA1P38398 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRCA1P38398 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRCA1P38398 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BRCA1P38398 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRCA1P38398 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRCA1P38398 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRCA1P38398 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRCA1P38398 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRCA1P38398 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRCA1P38398 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRCA1P38398 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRCA1P38398 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRCA1P38398 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRCA1P38398 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRCA1P38398 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRCA1P38398 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BRCA1P38398 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BRCA1P38398 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BRCA1P38398 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms