Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CHI3L1P36222 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHI3L1P36222 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CHI3L1P36222 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHI3L1P36222 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHI3L1P36222 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHI3L1P36222 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHI3L1P36222 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHI3L1P36222 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHI3L1P36222 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHI3L1P36222 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHI3L1P36222 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHI3L1P36222 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHI3L1P36222 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHI3L1P36222 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms