Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYH11P35749 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYH11P35749 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYH11P35749 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MYH11P35749 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MYH11P35749 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MYH11P35749 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYH11P35749 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYH11P35749 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYH11P35749 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MYH11P35749 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYH11P35749 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYH11P35749 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYH11P35749 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYH11P35749 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYH11P35749 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYH11P35749 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYH11P35749 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYH11P35749 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYH11P35749 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYH11P35749 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYH11P35749 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYH11P35749 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYH11P35749 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYH11P35749 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYH11P35749 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MYH11P35749 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYH11P35749 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYH11P35749 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYH11P35749 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYH11P35749 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYH11P35749 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYH11P35749 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYH11P35749 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYH11P35749 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYH11P35749 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYH11P35749 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYH11P35749 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYH11P35749 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MYH11P35749 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYH11P35749 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYH11P35749 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYH11P35749 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MYH11P35749 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYH11P35749 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYH11P35749 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYH11P35749 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYH11P35749 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYH11P35749 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYH11P35749 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYH11P35749 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYH11P35749 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYH11P35749 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYH11P35749 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYH11P35749 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYH11P35749 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYH11P35749 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYH11P35749 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYH11P35749 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MYH11P35749 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYH11P35749 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYH11P35749 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYH11P35749 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYH11P35749 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYH11P35749 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYH11P35749 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYH11P35749 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYH11P35749 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MYH11P35749 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYH11P35749 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYH11P35749 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYH11P35749 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYH11P35749 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYH11P35749 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYH11P35749 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYH11P35749 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYH11P35749 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MYH11P35749 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MYH11P35749 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYH11P35749 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MYH11P35749 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYH11P35749 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYH11P35749 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYH11P35749 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYH11P35749 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYH11P35749 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYH11P35749 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYH11P35749 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYH11P35749 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYH11P35749 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYH11P35749 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYH11P35749 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MYH11P35749 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYH11P35749 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYH11P35749 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYH11P35749 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYH11P35749 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MYH11P35749 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MYH11P35749 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
MYH11P35749 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms