Protein–RNA interactions for Protein: P35240

NF2, Merlin, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF2P35240 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NF2P35240 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NF2P35240 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NF2P35240 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NF2P35240 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NF2P35240 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NF2P35240 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NF2P35240 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NF2P35240 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NF2P35240 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NF2P35240 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NF2P35240 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NF2P35240 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NF2P35240 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NF2P35240 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NF2P35240 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NF2P35240 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NF2P35240 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NF2P35240 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NF2P35240 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NF2P35240 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NF2P35240 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NF2P35240 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NF2P35240 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NF2P35240 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NF2P35240 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NF2P35240 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NF2P35240 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NF2P35240 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NF2P35240 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NF2P35240 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NF2P35240 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NF2P35240 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NF2P35240 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NF2P35240 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NF2P35240 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NF2P35240 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NF2P35240 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NF2P35240 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NF2P35240 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NF2P35240 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NF2P35240 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NF2P35240 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NF2P35240 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NF2P35240 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NF2P35240 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NF2P35240 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NF2P35240 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NF2P35240 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NF2P35240 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NF2P35240 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NF2P35240 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NF2P35240 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NF2P35240 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NF2P35240 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NF2P35240 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NF2P35240 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NF2P35240 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NF2P35240 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NF2P35240 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NF2P35240 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NF2P35240 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NF2P35240 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NF2P35240 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NF2P35240 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NF2P35240 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NF2P35240 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NF2P35240 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NF2P35240 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NF2P35240 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NF2P35240 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NF2P35240 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NF2P35240 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NF2P35240 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NF2P35240 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NF2P35240 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NF2P35240 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NF2P35240 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NF2P35240 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NF2P35240 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NF2P35240 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NF2P35240 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NF2P35240 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NF2P35240 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NF2P35240 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NF2P35240 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NF2P35240 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NF2P35240 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NF2P35240 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NF2P35240 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NF2P35240 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NF2P35240 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NF2P35240 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NF2P35240 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NF2P35240 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NF2P35240 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NF2P35240 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NF2P35240 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NF2P35240 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NF2P35240 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms