Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPC1P35052 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPC1P35052 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPC1P35052 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPC1P35052 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GPC1P35052 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GPC1P35052 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPC1P35052 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPC1P35052 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GPC1P35052 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPC1P35052 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPC1P35052 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPC1P35052 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPC1P35052 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPC1P35052 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPC1P35052 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPC1P35052 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPC1P35052 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPC1P35052 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPC1P35052 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPC1P35052 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPC1P35052 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPC1P35052 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPC1P35052 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPC1P35052 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPC1P35052 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GPC1P35052 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPC1P35052 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPC1P35052 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPC1P35052 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPC1P35052 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPC1P35052 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPC1P35052 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPC1P35052 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPC1P35052 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPC1P35052 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPC1P35052 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPC1P35052 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPC1P35052 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPC1P35052 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPC1P35052 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPC1P35052 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPC1P35052 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GPC1P35052 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPC1P35052 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPC1P35052 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPC1P35052 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPC1P35052 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPC1P35052 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPC1P35052 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPC1P35052 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPC1P35052 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPC1P35052 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GPC1P35052 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPC1P35052 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPC1P35052 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPC1P35052 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPC1P35052 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPC1P35052 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPC1P35052 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPC1P35052 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GPC1P35052 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPC1P35052 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPC1P35052 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPC1P35052 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPC1P35052 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPC1P35052 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPC1P35052 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GPC1P35052 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPC1P35052 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPC1P35052 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPC1P35052 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPC1P35052 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPC1P35052 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GPC1P35052 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPC1P35052 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPC1P35052 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPC1P35052 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPC1P35052 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPC1P35052 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPC1P35052 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPC1P35052 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPC1P35052 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPC1P35052 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GPC1P35052 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GPC1P35052 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPC1P35052 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPC1P35052 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPC1P35052 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPC1P35052 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPC1P35052 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPC1P35052 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPC1P35052 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GPC1P35052 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPC1P35052 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPC1P35052 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPC1P35052 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPC1P35052 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPC1P35052 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GPC1P35052 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms