Protein–RNA interactions for Protein: P34220

YBL055C, Deoxyribonuclease Tat-D, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL055CP34220 CRM1YGR218W 3255 nt2.15□□□□□ -2.06
YBL055CP34220 RTT102YGR275W 474 nt2.15□□□□□ -2.07
YBL055CP34220 VTI1YMR197C 654 nt2.15□□□□□ -2.07
YBL055CP34220 YPL238CYPL238C 390 nt2.15□□□□□ -2.07
YBL055CP34220 MGM1YOR211C 2646 nt2.15□□□□□ -2.07
YBL055CP34220 SPO22YIL073C 2928 nt2.14□□□□□ -2.07
YBL055CP34220 IST2YBR086C 2841 nt2.14□□□□□ -2.07
YBL055CP34220 HIT1YJR055W 495 nt2.14□□□□□ -2.07
YBL055CP34220 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt2.14□□□□□ -2.07
YBL055CP34220 RIC1YLR039C 3171 nt2.14□□□□□ -2.07
YBL055CP34220 BNI1YNL271C 5862 nt2.13□□□□□ -2.07
YBL055CP34220 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.13□□□□□ -2.07
YBL055CP34220 YBR012CYBR012C 420 nt2.13□□□□□ -2.07
YBL055CP34220 GPX2YBR244W 489 nt2.13□□□□□ -2.07
YBL055CP34220 MET18YIL128W 3099 nt2.13□□□□□ -2.07
YBL055CP34220 RAV1YJR033C 4074 nt2.12□□□□□ -2.07
YBL055CP34220 QCR7YDR529C 384 nt2.12□□□□□ -2.07
YBL055CP34220 SEC31YDL195W 3822 nt2.11□□□□□ -2.07
YBL055CP34220 CDC27YBL084C 2277 nt2.11□□□□□ -2.07
YBL055CP34220 YDL118WYDL118W 381 nt2.11□□□□□ -2.07
YBL055CP34220 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt2.11□□□□□ -2.07
YBL055CP34220 YER137W-AYER137W-A 306 nt2.11□□□□□ -2.07
YBL055CP34220 YGL069CYGL069C 465 nt2.11□□□□□ -2.07
YBL055CP34220 YML009C-AYML009C-A 327 nt2.11□□□□□ -2.07
YBL055CP34220 RGA1YOR127W 3024 nt2.11□□□□□ -2.07
YBL055CP34220 GIP3YPL137C 3831 nt2.11□□□□□ -2.07
YBL055CP34220 NOT5YPR072W 1683 nt2.1□□□□□ -2.07
YBL055CP34220 TMA10YLR327C 261 nt2.1□□□□□ -2.07
YBL055CP34220 YOR121CYOR121C 306 nt2.1□□□□□ -2.07
YBL055CP34220 YOR333CYOR333C 417 nt2.1□□□□□ -2.07
YBL055CP34220 YPL182CYPL182C 384 nt2.1□□□□□ -2.07
YBL055CP34220 LYS9YNR050C 1341 nt2.1□□□□□ -2.07
YBL055CP34220 DOT6YER088C 2013 nt2.1□□□□□ -2.07
YBL055CP34220 RTT107YHR154W 3213 nt2.1□□□□□ -2.07
YBL055CP34220 VMR1YHL035C 4779 nt2.09□□□□□ -2.07
YBL055CP34220 YBR224WYBR224W 516 nt2.09□□□□□ -2.07
YBL055CP34220 STB4YMR019W 2850 nt2.08□□□□□ -2.08
YBL055CP34220 NEO1YIL048W 3456 nt2.08□□□□□ -2.08
YBL055CP34220 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.08□□□□□ -2.08
YBL055CP34220 EMP24YGL200C 612 nt2.08□□□□□ -2.08
YBL055CP34220 FKS1YLR342W 5631 nt2.08□□□□□ -2.08
YBL055CP34220 RTT101YJL047C 2529 nt2.08□□□□□ -2.08
YBL055CP34220 YLR149CYLR149C 2193 nt2.08□□□□□ -2.08
YBL055CP34220 YDL011CYDL011C 324 nt2.07□□□□□ -2.08
YBL055CP34220 YGL239CYGL239C 315 nt2.07□□□□□ -2.08
YBL055CP34220 YBL012CYBL012C 402 nt2.07□□□□□ -2.08
YBL055CP34220 RPL9BYNL067W 576 nt2.07□□□□□ -2.08
YBL055CP34220 YPR099CYPR099C 357 nt2.07□□□□□ -2.08
YBL055CP34220 TOR2YKL203C 7425 nt2.07□□□□□ -2.08
YBL055CP34220 RUD3YOR216C 1455 nt2.07□□□□□ -2.08
YBL055CP34220 SMY1YKL079W 1971 nt2.07□□□□□ -2.08
YBL055CP34220 MNE1YOR350C 1992 nt2.07□□□□□ -2.08
YBL055CP34220 GYP5YPL249C 2685 nt2.06□□□□□ -2.08
YBL055CP34220 SET2YJL168C 2202 nt2.06□□□□□ -2.08
YBL055CP34220 PUT3YKL015W 2940 nt2.06□□□□□ -2.08
YBL055CP34220 VPH1YOR270C 2523 nt2.06□□□□□ -2.08
YBL055CP34220 RBK1YCR036W 1002 nt2.06□□□□□ -2.08
YBL055CP34220 YDR286CYDR286C 345 nt2.06□□□□□ -2.08
YBL055CP34220 HOP2YGL033W 657 nt2.06□□□□□ -2.08
YBL055CP34220 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt2.06□□□□□ -2.08
YBL055CP34220 MNL2YLR057W 2550 nt2.06□□□□□ -2.08
YBL055CP34220 ELG1YOR144C 2376 nt2.06□□□□□ -2.08
YBL055CP34220 SNF5YBR289W 2718 nt2.05□□□□□ -2.08
YBL055CP34220 PEP3YLR148W 2757 nt2.05□□□□□ -2.08
YBL055CP34220 WIP1YDR374W-A 270 nt2.05□□□□□ -2.08
YBL055CP34220 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt2.05□□□□□ -2.08
YBL055CP34220 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.05□□□□□ -2.08
YBL055CP34220 YDL152WYDL152W 366 nt2.04□□□□□ -2.08
YBL055CP34220 BUD2YKL092C 3315 nt2.04□□□□□ -2.08
YBL055CP34220 HSK3YKL138C-A 210 nt2.04□□□□□ -2.08
YBL055CP34220 YBL108WYBL108W 306 nt2.04□□□□□ -2.08
YBL055CP34220 YBR184WYBR184W 1572 nt2.04□□□□□ -2.08
YBL055CP34220 COS111YBR203W 2775 nt2.03□□□□□ -2.08
YBL055CP34220 YGR035CYGR035C 351 nt2.03□□□□□ -2.08
YBL055CP34220 YBL083CYBL083C 426 nt2.03□□□□□ -2.08
YBL055CP34220 YPR197CYPR197C 564 nt2.03□□□□□ -2.08
YBL055CP34220 TRL1YJL087C 2484 nt2.03□□□□□ -2.08
YBL055CP34220 PAN3YKL025C 2040 nt2.03□□□□□ -2.08
YBL055CP34220 DIS3YOL021C 3006 nt2.02□□□□□ -2.09
YBL055CP34220 SEF1YBL066C 3447 nt2.02□□□□□ -2.09
YBL055CP34220 DAD4YDR320C-A 219 nt2.02□□□□□ -2.09
YBL055CP34220 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt2.02□□□□□ -2.09
YBL055CP34220 PCF11YDR228C 1881 nt2.02□□□□□ -2.09
YBL055CP34220 TOF2YKR010C 2316 nt2.01□□□□□ -2.09
YBL055CP34220 GRR1YJR090C 3456 nt2.01□□□□□ -2.09
YBL055CP34220 YAP6YDR259C 1152 nt2.01□□□□□ -2.09
YBL055CP34220 YLR053CYLR053C 327 nt2.01□□□□□ -2.09
YBL055CP34220 RPL26AYLR344W 384 nt2.01□□□□□ -2.09
YBL055CP34220 YNL058CYNL058C 951 nt2.01□□□□□ -2.09
YBL055CP34220 YJR003CYJR003C 1560 nt2.01□□□□□ -2.09
YBL055CP34220 SAC3YDR159W 3906 nt2□□□□□ -2.09
YBL055CP34220 SLM1YIL105C 2061 nt2□□□□□ -2.09
YBL055CP34220 RTR1YER139C 681 nt2□□□□□ -2.09
YBL055CP34220 TIM13YGR181W 318 nt2□□□□□ -2.09
YBL055CP34220 CDC60YPL160W 3273 nt2□□□□□ -2.09
YBL055CP34220 ATG9YDL149W 2994 nt2□□□□□ -2.09
YBL055CP34220 VPS8YAL002W 3825 nt2□□□□□ -2.09
YBL055CP34220 YDL062WYDL062W 426 nt1.99□□□□□ -2.09
YBL055CP34220 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt1.99□□□□□ -2.09
YBL055CP34220 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt1.99□□□□□ -2.09
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