Protein–RNA interactions for Protein: P34077

NIC96, Nucleoporin NIC96, yeastyeast

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIC96P34077 DAD3YBR233W-A 285 nt2.44□□□□□ -2.02
NIC96P34077 SEC26YDR238C 2922 nt2.44□□□□□ -2.02
NIC96P34077 RTT107YHR154W 3213 nt2.44□□□□□ -2.02
NIC96P34077 SPF1YEL031W 3648 nt2.43□□□□□ -2.02
NIC96P34077 YDL011CYDL011C 324 nt2.43□□□□□ -2.02
NIC96P34077 RPL26AYLR344W 384 nt2.43□□□□□ -2.02
NIC96P34077 RPL9BYNL067W 576 nt2.43□□□□□ -2.02
NIC96P34077 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt2.43□□□□□ -2.02
NIC96P34077 GRR1YJR090C 3456 nt2.43□□□□□ -2.02
NIC96P34077 MNL2YLR057W 2550 nt2.43□□□□□ -2.02
NIC96P34077 PEP3YLR148W 2757 nt2.43□□□□□ -2.02
NIC96P34077 LYS9YNR050C 1341 nt2.42□□□□□ -2.02
NIC96P34077 YPL150WYPL150W 2706 nt2.42□□□□□ -2.02
NIC96P34077 TRL1YJL087C 2484 nt2.42□□□□□ -2.02
NIC96P34077 HOP2YGL033W 657 nt2.42□□□□□ -2.02
NIC96P34077 YKL083WYKL083W 615 nt2.42□□□□□ -2.02
NIC96P34077 YBL073WYBL073W 312 nt2.42□□□□□ -2.02
NIC96P34077 PGA1YNL158W 597 nt2.42□□□□□ -2.02
NIC96P34077 IRC23YOR044W 474 nt2.42□□□□□ -2.02
NIC96P34077 SET2YJL168C 2202 nt2.42□□□□□ -2.02
NIC96P34077 DIS3YOL021C 3006 nt2.42□□□□□ -2.02
NIC96P34077 RBK1YCR036W 1002 nt2.41□□□□□ -2.02
NIC96P34077 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt2.41□□□□□ -2.02
NIC96P34077 YOR282WYOR282W 321 nt2.41□□□□□ -2.02
NIC96P34077 snR36snR36 182 nt2.41□□□□□ -2.02
NIC96P34077 VMA9YCL005W-A 222 nt2.41□□□□□ -2.02
NIC96P34077 SGS1YMR190C 4344 nt2.41□□□□□ -2.02
NIC96P34077 SIR4YDR227W 4077 nt2.41□□□□□ -2.02
NIC96P34077 SNF5YBR289W 2718 nt2.4□□□□□ -2.02
NIC96P34077 YBR184WYBR184W 1572 nt2.4□□□□□ -2.02
NIC96P34077 GIP3YPL137C 3831 nt2.4□□□□□ -2.02
NIC96P34077 VPS41YDR080W 2979 nt2.4□□□□□ -2.03
NIC96P34077 MBB1YJL199C 327 nt2.4□□□□□ -2.03
NIC96P34077 HSK3YKL138C-A 210 nt2.4□□□□□ -2.03
NIC96P34077 COA4YLR218C 453 nt2.4□□□□□ -2.03
NIC96P34077 ISF1YMR081C 1017 nt2.4□□□□□ -2.03
NIC96P34077 SMC6YLR383W 3345 nt2.4□□□□□ -2.03
NIC96P34077 PCF11YDR228C 1881 nt2.39□□□□□ -2.03
NIC96P34077 IST2YBR086C 2841 nt2.39□□□□□ -2.03
NIC96P34077 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.39□□□□□ -2.03
NIC96P34077 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.39□□□□□ -2.03
NIC96P34077 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.39□□□□□ -2.03
NIC96P34077 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.39□□□□□ -2.03
NIC96P34077 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt2.39□□□□□ -2.03
NIC96P34077 YLR053CYLR053C 327 nt2.39□□□□□ -2.03
NIC96P34077 YAR029WYAR029W 225 nt2.39□□□□□ -2.03
NIC96P34077 RPS12YOR369C 432 nt2.39□□□□□ -2.03
NIC96P34077 PAN3YKL025C 2040 nt2.39□□□□□ -2.03
NIC96P34077 SEF1YBL066C 3447 nt2.39□□□□□ -2.03
NIC96P34077 TOF2YKR010C 2316 nt2.39□□□□□ -2.03
NIC96P34077 ZRG8YER033C 3231 nt2.38□□□□□ -2.03
NIC96P34077 RTT101YJL047C 2529 nt2.38□□□□□ -2.03
NIC96P34077 VMR1YHL035C 4779 nt2.38□□□□□ -2.03
NIC96P34077 RSE1YML049C 4086 nt2.38□□□□□ -2.03
NIC96P34077 UBP15YMR304W 3693 nt2.38□□□□□ -2.03
NIC96P34077 YBL083CYBL083C 426 nt2.38□□□□□ -2.03
NIC96P34077 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.38□□□□□ -2.03
NIC96P34077 YBP1YBR216C 2025 nt2.38□□□□□ -2.03
NIC96P34077 STE5YDR103W 2754 nt2.38□□□□□ -2.03
NIC96P34077 SLM1YIL105C 2061 nt2.37□□□□□ -2.03
NIC96P34077 CDC60YPL160W 3273 nt2.37□□□□□ -2.03
NIC96P34077 VTC3YPL019C 2508 nt2.36□□□□□ -2.03
NIC96P34077 ARP8YOR141C 2646 nt2.36□□□□□ -2.03
NIC96P34077 DAD4YDR320C-A 219 nt2.36□□□□□ -2.03
NIC96P34077 PSY1YKL076C 384 nt2.36□□□□□ -2.03
NIC96P34077 PHO91YNR013C 2685 nt2.36□□□□□ -2.03
NIC96P34077 IRR1YIL026C 3453 nt2.35□□□□□ -2.03
NIC96P34077 YCR043CYCR043C 384 nt2.35□□□□□ -2.03
NIC96P34077 HCH1YNL281W 462 nt2.35□□□□□ -2.03
NIC96P34077 YPL229WYPL229W 621 nt2.35□□□□□ -2.03
NIC96P34077 YDR341CYDR341C 1824 nt2.35□□□□□ -2.03
NIC96P34077 YDL062WYDL062W 426 nt2.34□□□□□ -2.03
NIC96P34077 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt2.34□□□□□ -2.03
NIC96P34077 YEL057CYEL057C 702 nt2.34□□□□□ -2.03
NIC96P34077 TIM13YGR181W 318 nt2.34□□□□□ -2.03
NIC96P34077 RPL39YJL189W 156 nt2.34□□□□□ -2.03
NIC96P34077 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.34□□□□□ -2.03
NIC96P34077 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt2.34□□□□□ -2.03
NIC96P34077 AIM9YER080W 1884 nt2.34□□□□□ -2.03
NIC96P34077 PTP3YER075C 2787 nt2.33□□□□□ -2.04
NIC96P34077 TMN3YER113C 2121 nt2.33□□□□□ -2.04
NIC96P34077 YOL098CYOL098C 3114 nt2.33□□□□□ -2.04
NIC96P34077 SVL3YPL032C 2478 nt2.33□□□□□ -2.04
NIC96P34077 PDR1YGL013C 3207 nt2.33□□□□□ -2.04
NIC96P34077 SKP2YNL311C 2292 nt2.33□□□□□ -2.04
NIC96P34077 RPS24AYER074W 408 nt2.33□□□□□ -2.04
NIC96P34077 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt2.33□□□□□ -2.04
NIC96P34077 CYB5YNL111C 363 nt2.33□□□□□ -2.04
NIC96P34077 YEF3YLR249W 3135 nt2.33□□□□□ -2.04
NIC96P34077 NEW1YPL226W 3591 nt2.33□□□□□ -2.04
NIC96P34077 JIP5YPR169W 1479 nt2.33□□□□□ -2.04
NIC96P34077 DNA2YHR164C 4569 nt2.32□□□□□ -2.04
NIC96P34077 SYH1YPL105C 2550 nt2.32□□□□□ -2.04
NIC96P34077 snR8snR8 190 nt2.32□□□□□ -2.04
NIC96P34077 RPS27AYKL156W 249 nt2.32□□□□□ -2.04
NIC96P34077 RPH1YER169W 2391 nt2.31□□□□□ -2.04
NIC96P34077 SSD1YDR293C 3753 nt2.31□□□□□ -2.04
NIC96P34077 HMRA2YCR096C 360 nt2.31□□□□□ -2.04
NIC96P34077 RPL37BYDR500C 267 nt2.31□□□□□ -2.04
NIC96P34077 YFL063WYFL063W 456 nt2.31□□□□□ -2.04
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