Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCR5P32302 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms