Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CASQ1P31415 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CASQ1P31415 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
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