Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms