Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXA7P31268 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXA7P31268 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms