Protein–RNA interactions for Protein: P30520

ADSS, Adenylosuccinate synthetase isozyme 2, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ADSSP30520 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ADSSP30520 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ADSSP30520 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ADSSP30520 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ADSSP30520 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ADSSP30520 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ADSSP30520 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ADSSP30520 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ADSSP30520 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ADSSP30520 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ADSSP30520 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ADSSP30520 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ADSSP30520 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ADSSP30520 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ADSSP30520 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ADSSP30520 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ADSSP30520 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ADSSP30520 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ADSSP30520 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ADSSP30520 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ADSSP30520 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ADSSP30520 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ADSSP30520 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ADSSP30520 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ADSSP30520 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ADSSP30520 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ADSSP30520 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ADSSP30520 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ADSSP30520 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ADSSP30520 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ADSSP30520 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ADSSP30520 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ADSSP30520 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ADSSP30520 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ADSSP30520 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ADSSP30520 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ADSSP30520 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ADSSP30520 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ADSSP30520 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ADSSP30520 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ADSSP30520 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ADSSP30520 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ADSSP30520 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ADSSP30520 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ADSSP30520 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ADSSP30520 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ADSSP30520 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ADSSP30520 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ADSSP30520 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ADSSP30520 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ADSSP30520 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ADSSP30520 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ADSSP30520 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ADSSP30520 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ADSSP30520 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ADSSP30520 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ADSSP30520 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ADSSP30520 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ADSSP30520 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ADSSP30520 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ADSSP30520 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ADSSP30520 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ADSSP30520 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ADSSP30520 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ADSSP30520 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ADSSP30520 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ADSSP30520 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ADSSP30520 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ADSSP30520 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ADSSP30520 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ADSSP30520 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ADSSP30520 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ADSSP30520 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ADSSP30520 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ADSSP30520 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ADSSP30520 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ADSSP30520 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ADSSP30520 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ADSSP30520 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ADSSP30520 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ADSSP30520 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ADSSP30520 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ADSSP30520 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ADSSP30520 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ADSSP30520 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ADSSP30520 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ADSSP30520 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ADSSP30520 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ADSSP30520 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ADSSP30520 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ADSSP30520 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ADSSP30520 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ADSSP30520 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ADSSP30520 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ADSSP30520 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ADSSP30520 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ADSSP30520 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ADSSP30520 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ADSSP30520 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ADSSP30520 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms