Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CNGA1P29973 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms