Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
PTPRMP28827 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC30■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PTPRMP28827 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRMP28827 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
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