Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DUSP1P28562 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms