Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
HLA-DMAP28067 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms