Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMO2P25791 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMO2P25791 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMO2P25791 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMO2P25791 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMO2P25791 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMO2P25791 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LMO2P25791 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LMO2P25791 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LMO2P25791 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LMO2P25791 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LMO2P25791 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
LMO2P25791 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMO2P25791 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMO2P25791 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMO2P25791 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMO2P25791 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMO2P25791 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMO2P25791 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMO2P25791 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMO2P25791 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMO2P25791 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMO2P25791 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMO2P25791 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMO2P25791 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMO2P25791 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMO2P25791 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMO2P25791 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMO2P25791 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMO2P25791 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMO2P25791 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMO2P25791 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LMO2P25791 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMO2P25791 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMO2P25791 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMO2P25791 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMO2P25791 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMO2P25791 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMO2P25791 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMO2P25791 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMO2P25791 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMO2P25791 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMO2P25791 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMO2P25791 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMO2P25791 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LMO2P25791 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LMO2P25791 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMO2P25791 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMO2P25791 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMO2P25791 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMO2P25791 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMO2P25791 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMO2P25791 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMO2P25791 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMO2P25791 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LMO2P25791 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMO2P25791 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMO2P25791 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMO2P25791 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMO2P25791 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMO2P25791 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMO2P25791 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LMO2P25791 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMO2P25791 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LMO2P25791 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMO2P25791 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LMO2P25791 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO2P25791 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO2P25791 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO2P25791 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO2P25791 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO2P25791 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO2P25791 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO2P25791 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO2P25791 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO2P25791 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO2P25791 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO2P25791 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO2P25791 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO2P25791 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO2P25791 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO2P25791 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO2P25791 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO2P25791 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO2P25791 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO2P25791 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO2P25791 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO2P25791 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO2P25791 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO2P25791 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LMO2P25791 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO2P25791 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO2P25791 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO2P25791 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO2P25791 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO2P25791 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO2P25791 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO2P25791 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO2P25791 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LMO2P25791 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms