Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ITGA6P23229 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ITGA6P23229 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms