Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FGFR4P22455 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FGFR4P22455 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms