Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RAB5AP20339 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RAB5AP20339 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms