Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD58P19256 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CD58P19256 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD58P19256 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD58P19256 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD58P19256 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CD58P19256 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CD58P19256 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CD58P19256 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD58P19256 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD58P19256 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD58P19256 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD58P19256 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CD58P19256 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD58P19256 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD58P19256 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CD58P19256 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD58P19256 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD58P19256 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD58P19256 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD58P19256 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD58P19256 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD58P19256 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD58P19256 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD58P19256 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CD58P19256 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CD58P19256 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD58P19256 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD58P19256 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD58P19256 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD58P19256 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD58P19256 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD58P19256 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD58P19256 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD58P19256 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CD58P19256 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD58P19256 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD58P19256 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD58P19256 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD58P19256 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD58P19256 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD58P19256 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD58P19256 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD58P19256 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD58P19256 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD58P19256 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD58P19256 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CD58P19256 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD58P19256 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD58P19256 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD58P19256 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD58P19256 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD58P19256 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD58P19256 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD58P19256 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CD58P19256 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD58P19256 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD58P19256 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD58P19256 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD58P19256 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD58P19256 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD58P19256 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD58P19256 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD58P19256 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD58P19256 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD58P19256 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD58P19256 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD58P19256 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CD58P19256 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD58P19256 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD58P19256 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD58P19256 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD58P19256 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD58P19256 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD58P19256 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD58P19256 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD58P19256 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD58P19256 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD58P19256 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CD58P19256 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD58P19256 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD58P19256 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CD58P19256 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD58P19256 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD58P19256 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD58P19256 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD58P19256 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD58P19256 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD58P19256 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD58P19256 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD58P19256 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CD58P19256 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CD58P19256 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD58P19256 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD58P19256 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD58P19256 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD58P19256 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD58P19256 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CD58P19256 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CD58P19256 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms