Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATF3P18847 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATF3P18847 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ATF3P18847 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATF3P18847 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATF3P18847 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATF3P18847 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATF3P18847 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ATF3P18847 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATF3P18847 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATF3P18847 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATF3P18847 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATF3P18847 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATF3P18847 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATF3P18847 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATF3P18847 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATF3P18847 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATF3P18847 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATF3P18847 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ATF3P18847 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATF3P18847 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATF3P18847 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATF3P18847 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATF3P18847 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ATF3P18847 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATF3P18847 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATF3P18847 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATF3P18847 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATF3P18847 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATF3P18847 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATF3P18847 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATF3P18847 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATF3P18847 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATF3P18847 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATF3P18847 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATF3P18847 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATF3P18847 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATF3P18847 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATF3P18847 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATF3P18847 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATF3P18847 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATF3P18847 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATF3P18847 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATF3P18847 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATF3P18847 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATF3P18847 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATF3P18847 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATF3P18847 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATF3P18847 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATF3P18847 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATF3P18847 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATF3P18847 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATF3P18847 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATF3P18847 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATF3P18847 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATF3P18847 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATF3P18847 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATF3P18847 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATF3P18847 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATF3P18847 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATF3P18847 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATF3P18847 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATF3P18847 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATF3P18847 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATF3P18847 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATF3P18847 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATF3P18847 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATF3P18847 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ATF3P18847 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATF3P18847 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATF3P18847 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATF3P18847 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATF3P18847 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATF3P18847 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATF3P18847 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATF3P18847 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATF3P18847 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATF3P18847 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATF3P18847 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATF3P18847 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATF3P18847 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATF3P18847 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATF3P18847 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATF3P18847 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ATF3P18847 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATF3P18847 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATF3P18847 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATF3P18847 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATF3P18847 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATF3P18847 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATF3P18847 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATF3P18847 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATF3P18847 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATF3P18847 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ATF3P18847 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATF3P18847 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ATF3P18847 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATF3P18847 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATF3P18847 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATF3P18847 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms