Protein–RNA interactions for Protein: P17655

CAPN2, Calpain-2 catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN2P17655 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPN2P17655 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms