Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ITGB4P16144 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ITGB4P16144 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms