Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CSF2RAP15509 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CSF2RAP15509 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms