Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 AL109935.1-201ENST00000413249 473 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HOXB1P14653 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms