Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM27P14373 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM27P14373 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM27P14373 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM27P14373 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM27P14373 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM27P14373 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM27P14373 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM27P14373 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM27P14373 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM27P14373 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM27P14373 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM27P14373 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM27P14373 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM27P14373 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM27P14373 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM27P14373 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM27P14373 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM27P14373 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM27P14373 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM27P14373 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM27P14373 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM27P14373 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM27P14373 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM27P14373 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM27P14373 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM27P14373 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms