Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ITGA4P13612 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA4P13612 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms