Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ACTN1P12814 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTN1P12814 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms