Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MS4A1P11836 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MS4A1P11836 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MS4A1P11836 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MS4A1P11836 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MS4A1P11836 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MS4A1P11836 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MS4A1P11836 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MS4A1P11836 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MS4A1P11836 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MS4A1P11836 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MS4A1P11836 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MS4A1P11836 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms