Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC35.82■■■■□ 3.33
TOP2AP11388 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC35.81■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC35.78■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
TOP2AP11388 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
TOP2AP11388 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
TOP2AP11388 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC35.76■■■■□ 3.31
TOP2AP11388 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.31
TOP2AP11388 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC35.76■■■■□ 3.31
TOP2AP11388 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
TOP2AP11388 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
TOP2AP11388 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
TOP2AP11388 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
TOP2AP11388 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TOP2AP11388 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TOP2AP11388 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TOP2AP11388 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
TOP2AP11388 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TOP2AP11388 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TOP2AP11388 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TOP2AP11388 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TOP2AP11388 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TOP2AP11388 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TOP2AP11388 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TOP2AP11388 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
TOP2AP11388 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TOP2AP11388 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
TOP2AP11388 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
TOP2AP11388 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
TOP2AP11388 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
TOP2AP11388 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TOP2AP11388 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TOP2AP11388 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
TOP2AP11388 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TOP2AP11388 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TOP2AP11388 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
TOP2AP11388 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TOP2AP11388 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
TOP2AP11388 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms