Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms