Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PGA3P0DJD8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms