Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTAP09496 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTAP09496 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTAP09496 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CLTAP09496 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLTAP09496 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLTAP09496 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CLTAP09496 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLTAP09496 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLTAP09496 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLTAP09496 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLTAP09496 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLTAP09496 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLTAP09496 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLTAP09496 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLTAP09496 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLTAP09496 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLTAP09496 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLTAP09496 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLTAP09496 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLTAP09496 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CLTAP09496 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTAP09496 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTAP09496 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTAP09496 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTAP09496 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTAP09496 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTAP09496 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTAP09496 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTAP09496 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTAP09496 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTAP09496 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTAP09496 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTAP09496 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTAP09496 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTAP09496 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTAP09496 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTAP09496 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTAP09496 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTAP09496 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTAP09496 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CLTAP09496 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTAP09496 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTAP09496 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTAP09496 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTAP09496 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTAP09496 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTAP09496 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTAP09496 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTAP09496 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTAP09496 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTAP09496 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTAP09496 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTAP09496 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTAP09496 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTAP09496 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CLTAP09496 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTAP09496 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTAP09496 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTAP09496 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTAP09496 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTAP09496 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTAP09496 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTAP09496 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTAP09496 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTAP09496 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTAP09496 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTAP09496 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTAP09496 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTAP09496 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTAP09496 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTAP09496 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTAP09496 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTAP09496 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTAP09496 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTAP09496 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTAP09496 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTAP09496 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLTAP09496 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTAP09496 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTAP09496 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTAP09496 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTAP09496 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTAP09496 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTAP09496 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTAP09496 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTAP09496 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTAP09496 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTAP09496 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTAP09496 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTAP09496 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTAP09496 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTAP09496 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTAP09496 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTAP09496 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTAP09496 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTAP09496 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTAP09496 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLTAP09496 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLTAP09496 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms