Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB1P08034 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB1P08034 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB1P08034 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB1P08034 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB1P08034 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB1P08034 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB1P08034 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB1P08034 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB1P08034 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB1P08034 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB1P08034 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB1P08034 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB1P08034 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB1P08034 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GJB1P08034 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB1P08034 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB1P08034 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB1P08034 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB1P08034 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB1P08034 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB1P08034 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB1P08034 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB1P08034 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB1P08034 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB1P08034 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB1P08034 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB1P08034 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GJB1P08034 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB1P08034 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB1P08034 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB1P08034 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB1P08034 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB1P08034 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB1P08034 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB1P08034 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB1P08034 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB1P08034 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB1P08034 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB1P08034 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB1P08034 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB1P08034 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB1P08034 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB1P08034 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB1P08034 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB1P08034 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GJB1P08034 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GJB1P08034 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GJB1P08034 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GJB1P08034 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GJB1P08034 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GJB1P08034 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJB1P08034 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJB1P08034 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJB1P08034 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GJB1P08034 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GJB1P08034 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJB1P08034 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJB1P08034 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJB1P08034 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GJB1P08034 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GJB1P08034 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GJB1P08034 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GJB1P08034 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GJB1P08034 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJB1P08034 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GJB1P08034 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJB1P08034 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJB1P08034 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJB1P08034 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJB1P08034 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GJB1P08034 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
GJB1P08034 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB1P08034 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB1P08034 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB1P08034 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB1P08034 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB1P08034 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB1P08034 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB1P08034 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB1P08034 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB1P08034 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB1P08034 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB1P08034 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB1P08034 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB1P08034 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB1P08034 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB1P08034 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB1P08034 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GJB1P08034 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB1P08034 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB1P08034 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB1P08034 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB1P08034 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB1P08034 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB1P08034 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB1P08034 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB1P08034 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB1P08034 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GJB1P08034 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms