Protein–RNA interactions for Protein: P05452

CLEC3B, Tetranectin, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC3BP05452 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CLEC3BP05452 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLEC3BP05452 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms