Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PF4P02776 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PF4P02776 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PF4P02776 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PF4P02776 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PF4P02776 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PF4P02776 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PF4P02776 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PF4P02776 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PF4P02776 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PF4P02776 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PF4P02776 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PF4P02776 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PF4P02776 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PF4P02776 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PF4P02776 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PF4P02776 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PF4P02776 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PF4P02776 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PF4P02776 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PF4P02776 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PF4P02776 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PF4P02776 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PF4P02776 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PF4P02776 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PF4P02776 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PF4P02776 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PF4P02776 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PF4P02776 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PF4P02776 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PF4P02776 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PF4P02776 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PF4P02776 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PF4P02776 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PF4P02776 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PF4P02776 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PF4P02776 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PF4P02776 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PF4P02776 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PF4P02776 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PF4P02776 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PF4P02776 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PF4P02776 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PF4P02776 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PF4P02776 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PF4P02776 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PF4P02776 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PF4P02776 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PF4P02776 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PF4P02776 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PF4P02776 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PF4P02776 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PF4P02776 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PF4P02776 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PF4P02776 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PF4P02776 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PF4P02776 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PF4P02776 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PF4P02776 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PF4P02776 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PF4P02776 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PF4P02776 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PF4P02776 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4P02776 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4P02776 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4P02776 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4P02776 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4P02776 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4P02776 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4P02776 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4P02776 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4P02776 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4P02776 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4P02776 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4P02776 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4P02776 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4P02776 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4P02776 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4P02776 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4P02776 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4P02776 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4P02776 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4P02776 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4P02776 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4P02776 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4P02776 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4P02776 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4P02776 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4P02776 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4P02776 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4P02776 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PF4P02776 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PF4P02776 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PF4P02776 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PF4P02776 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PF4P02776 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PF4P02776 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PF4P02776 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PF4P02776 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PF4P02776 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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