Protein–RNA interactions for Protein: P01008

SERPINC1, Antithrombin-III, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINC1P01008 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SERPINC1P01008 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SERPINC1P01008 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms