Protein–RNA interactions for Protein: P00338

LDHA, L-lactate dehydrogenase A chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHAP00338 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDHAP00338 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDHAP00338 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDHAP00338 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDHAP00338 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDHAP00338 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDHAP00338 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDHAP00338 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDHAP00338 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDHAP00338 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDHAP00338 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LDHAP00338 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDHAP00338 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDHAP00338 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDHAP00338 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDHAP00338 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDHAP00338 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDHAP00338 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LDHAP00338 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LDHAP00338 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LDHAP00338 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LDHAP00338 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LDHAP00338 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LDHAP00338 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDHAP00338 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LDHAP00338 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LDHAP00338 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LDHAP00338 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LDHAP00338 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDHAP00338 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDHAP00338 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDHAP00338 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDHAP00338 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LDHAP00338 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDHAP00338 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDHAP00338 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDHAP00338 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDHAP00338 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDHAP00338 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDHAP00338 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDHAP00338 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDHAP00338 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDHAP00338 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDHAP00338 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDHAP00338 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDHAP00338 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDHAP00338 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDHAP00338 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDHAP00338 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDHAP00338 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDHAP00338 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDHAP00338 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDHAP00338 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDHAP00338 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDHAP00338 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDHAP00338 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDHAP00338 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDHAP00338 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDHAP00338 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LDHAP00338 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDHAP00338 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDHAP00338 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDHAP00338 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDHAP00338 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LDHAP00338 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDHAP00338 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDHAP00338 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDHAP00338 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDHAP00338 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDHAP00338 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDHAP00338 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDHAP00338 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDHAP00338 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDHAP00338 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDHAP00338 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDHAP00338 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDHAP00338 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDHAP00338 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDHAP00338 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDHAP00338 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDHAP00338 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDHAP00338 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDHAP00338 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDHAP00338 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDHAP00338 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDHAP00338 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDHAP00338 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDHAP00338 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDHAP00338 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDHAP00338 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LDHAP00338 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDHAP00338 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LDHAP00338 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDHAP00338 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDHAP00338 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDHAP00338 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDHAP00338 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDHAP00338 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDHAP00338 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LDHAP00338 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms