Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
STAMBPO95630 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms