Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC24AO95486 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEC24AO95486 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SEC24AO95486 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms