Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLIT2O94813 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms