Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LANCL1O43813 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LANCL1O43813 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms