Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CLOCKO15516 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLOCKO15516 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms