Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYNMO15061 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SYNMO15061 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNMO15061 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNMO15061 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNMO15061 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNMO15061 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNMO15061 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNMO15061 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNMO15061 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNMO15061 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SYNMO15061 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNMO15061 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNMO15061 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNMO15061 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNMO15061 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNMO15061 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNMO15061 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNMO15061 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNMO15061 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNMO15061 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNMO15061 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNMO15061 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNMO15061 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNMO15061 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNMO15061 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNMO15061 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNMO15061 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SYNMO15061 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYNMO15061 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYNMO15061 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYNMO15061 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYNMO15061 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYNMO15061 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SYNMO15061 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SYNMO15061 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SYNMO15061 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SYNMO15061 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SYNMO15061 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SYNMO15061 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SYNMO15061 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SYNMO15061 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SYNMO15061 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SYNMO15061 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SYNMO15061 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SYNMO15061 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SYNMO15061 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SYNMO15061 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SYNMO15061 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYNMO15061 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYNMO15061 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYNMO15061 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYNMO15061 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SYNMO15061 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SYNMO15061 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYNMO15061 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYNMO15061 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYNMO15061 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYNMO15061 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYNMO15061 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYNMO15061 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SYNMO15061 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYNMO15061 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYNMO15061 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYNMO15061 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYNMO15061 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYNMO15061 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYNMO15061 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SYNMO15061 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYNMO15061 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYNMO15061 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SYNMO15061 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SYNMO15061 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYNMO15061 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SYNMO15061 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SYNMO15061 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SYNMO15061 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SYNMO15061 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SYNMO15061 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SYNMO15061 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SYNMO15061 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SYNMO15061 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SYNMO15061 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SYNMO15061 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SYNMO15061 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SYNMO15061 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYNMO15061 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYNMO15061 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYNMO15061 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYNMO15061 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
SYNMO15061 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYNMO15061 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYNMO15061 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYNMO15061 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYNMO15061 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYNMO15061 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYNMO15061 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYNMO15061 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SYNMO15061 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SYNMO15061 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms