Protein–RNA interactions for Protein: O00148

DDX39A, ATP-dependent RNA helicase DDX39A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39AO00148 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX39AO00148 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms