Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOC4-APOC2K7ER74 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms