Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
USP17L12C9JPN9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L12C9JPN9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L12C9JPN9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L12C9JPN9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L12C9JPN9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L12C9JPN9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L12C9JPN9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L12C9JPN9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L12C9JPN9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L12C9JPN9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L12C9JPN9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L12C9JPN9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L12C9JPN9 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L12C9JPN9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L12C9JPN9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L12C9JPN9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L12C9JPN9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L12C9JPN9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L12C9JPN9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
USP17L12C9JPN9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP17L12C9JPN9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms